Comme toutes plantes, les Artemisia annua et afra contiennent chacune plusieurs centaines de molécules. Une vingtaine de molécules actives contre le paludisme ont été identifiées. Celles-ci fonctionnent sans doute en synergie sur les parasites, à leurs différents stades d’évolution. L’Artemisia annua contient entre autres de l’artemisinine, inhibiteur de la beta-hémozoïne ; l’Artemisia afra non. Elles sont toutes deux efficaces contre le paludisme et la bilharziose.